1)运输结构：铁路、水路运输的中长途运输由公路运输承担，提高了综合运输成本；

2)运输连接：各种运输方式之间无有效连接，连接时间短、搬运、装卸、配送费用较高。我国的多式联运模式尚未得到普及。集装箱运输在美国和欧洲发达国家所占比例相对较高，共同比例为30-40%。与中国相比，集装箱运输仅占5.4%。基于集装箱的多模联运可以考虑到大规模成本和灵活性的优点；

3)交通不平衡：区域经济结构导致往返满载运输率失衡；

4)缺乏标准化。